Венеціанську республіку і університет в Падуї Везалий вибрав не випадково. Італія, вже вступила в благодатну пору доби Відродження, обіцяла йому надію вільно зайнятися улюбленою справою.
Падуанский університет XVI століття відрізнявся суворим статутом як для студентів, так і для викладачів. Претендент на отримання наукового ступеня здавав іспити професорам медичного факультету в присутності ректора університету. Везалий блискуче пройшов це випробування. Він натхненно провів публічне розтин і отримав звання професора хірургії та викладача анатомії.
Тут, в Падуанському університеті, студентів навчали біля ліжка хворого, що не практикувалося мало не з часів Гіппократа. Нарешті Везалию вдалося здійснити свій давно обдуманий метод викладання анатомії! Він сам виробляв розтину, сам показував студентам особливості будови внутрішніх органів.
Щоб вони краще засвоювали його лекції, могли повторювати їх, Везалий вирішив випробувати мальовані анатомічні таблиці і, хоча сам був неабияким малює, залучив до роботи свого земляка, художника Яна Стефана ван Калькара.
Анатомічні таблиці мали успіх, і в 1538 році Везалию вдається їх видати: три аркуші з докладним показом скелета, три - з замальовкою внутрішніх органів і кровоносних судин. У цій роботі вже відображені його власні уявлення про людський організм, але Везалий ще не вступає у відкритий суперечку з Галеном. Більше того, він бере участь у перекладі на латину розкішного видання творів Галена. Молодий професор, якому минуло двадцять чотири роки, отримав це почесне запрошення нарівні зі своїми викладачами Сильвием і Гунтеріусом.
Везалий вчив інших, навчався і сам. Спочатку він чесно прагнув зберегти авторитет Галена, але чим більше часу проводив у секційного столу, тим далі відходив від висновків «божественного» вчителя. Не раз в пошуках подробиць, описаних Галеном, він звертався до трупів тварин, розкривав собак, свиней, биків і саме у них знаходив те, що не міг виявити у людини.
Одного разу Везалий отримав замовлення від свого колеги - професора медицини Болонського університету альбом, який знадобився скелет мавпи. Виконуючи замовлення, Везалий несподівано виявив той гострий відросток в поперекових хребцях, який він, довіряючи описам Галена, марно шукав у людини. Так, тепер ясно: натурою для анатомії Галена в чому служили мавпи і інші тварини. Повного устрою людського тіла Гален не знав.
Це була без перебільшення титанічна робота описати і замалювати тіло людини таким, як воно є насправді. Це була ще і небезпечна затія.
Везалий не тішився надією, що йому вдасться уникнути конфлікту з церквою, що відноситься до творів Галена так, ніби вони були її священними книгами. Він наперед знав, що викличе обурення медиків-галенистов. Правда, не думав, що воно виявиться таким лютим.
Протягом чотирьох років писав Везалий книгу про будову людського тіла, яке він вивчав багато років. Він препарував, креслив, малював, і художник Калькар насилу встигав за анатомом.
У 1542 міланські купці Данон відправилися по своїх торгових справах в шлях, який пролягав через Альпи і Цюріх в Базель. Вони обіцяли виконати прохання Везалія і передати Базельському видавця Опорину рукопис і понад двісті гравюр по дереву. Це були трактат «Про будову людського тіла, в семи книгах» і як би своєрідний короткий конспект, який Везалий зробив зі своєї праці. Він назвав його «Витяг».
«Я зробив це« Витяг »як пішохідну стежку поруч з широкою дорогою - моєї великої книгою ...»
Опорин випустив у світ цей несхожий на інші трактат по анатомії влітку 1543.
Його автору було тоді двадцять вісім років.