Методи, застосовувані гігієною для виконання своїх завдань, дуже різноманітні. Будучи тісно пов'язана з хімією, фізикою, біологією, фізіологією, клінічної медициною, медичною статистикою та низкою інших дисциплін, гігієнічна наука в процесі свого розвитку використовувала багато сучасних найтонші методи досліджень для вивчення зовнішнього середовища, її впливу на людину і розробки комплексу гігієнічних та лікувально профілактичних заходів.
В гігієні широко використовуються хімічні методи дослідження. Цими методами проводяться аналізи хімічного складу повітря, визначення різних хімічних забруднень повітряного серед (гази, пил, дим). Суттєву роль відіграють фізичні методи для дослідження температури, вологості, руху повітря, шуму, теплового вивчення та ін. При цьому для тонкого аналізу використовуються багато досить досконалі фізико-хімічні методики (рефрактометрия, полярографія, фотоколориметрія, спектральний аналіз). За останні роки у зв'язку з появою радіаційного фактора стали широко застосовуватися методи оцінки радіоактивності повітряного середовища, води, харчових продуктів та ін. Бактеріологічні методи застосовуються для характеристики засіяні повітря, води, їжі, грунту та інших об'єктів зовнішнього середовища, які можуть виявитися причиною зараження людей інфекційними хворобами. Експериментально-токсикологічні методи, що дають, зокрема, можливість в дослідах на тваринах встановити гранично допустимі (нешкідливі для організму) концентрації отруйних домішок у повітрі, питній воді, продуктах харчування та ін. Клінічні методи, застосування яких дозволяє виявити в організмі людей такі зміни, які виникають в результаті впливу на людину різних шкідливих факторів навколишнього середовища. Як приклад можна вказати на ретельні клінічні дослідження при періодичних медичних оглядах працюючих у шкідливих цехах. Статистичні методи (математична статистика) дозволяють проаналізувати динаміку природного руху населення (народжуваність, смертність, приріст населення), захворюваності, фізичного розвитку і т. П., Зіставити отримані дані з умовами життя, побуту і праці в СРСР та інших країнах, встановити роль соціальної середовища в громадському здоров'ї.
Особливе місце серед використовуваних в гігієні методів займає санітарне обстеження, що полягає в загальному санітарному описі обстежуваного об'єкта (водойми, житла, школи, їдальні і т. П.). Застосовуючи в цих випадках найпростіші методики (вимірювання кубатури, характеристика санітарного стану приміщень, виявлення можливих джерел забруднення повітря, води, грунту), вдається намітити характер необхідних об'єктивних лабораторних досліджень, які дадуть можливість кількісно оцінити санітарні порушення, а надалі порівняти їх з встановленими гігієнічними нормативами, вжити необхідних заходів до їх усунення.
Слід зазначити тісний зв'язок гігієни з епідеміологією - наукою, яка з давніх пір користується санітарної практикою для виконання своєї провідної мети - профілактики та боротьби з епідемічними захворюваннями.