Повний судово-медичне дослідження трупа передбачає обов'язкове розтин не менше трьох порожнин - грудної, черевної і порожнини черепа. Крім того, обов'язково досліджують порожнину рота, тканини і органи шиї, м'язи, кістки. У необхідних випадках досліджують хребетний канал, додаткові пазухи черепа, великі суглоби.
Існує кілька методів розтину трупа. Залежно від конкретних умов експерт вправі обрати спосіб, що забезпечує повноту і якість дослідження.
Вельми важливо при судово-медичному дослідженні трупа дотримуватися послідовність дій. При виборі порожнини, з якою починають внутрішнє дослідження, слід керуватися даними зовнішнього огляду та відомостями, отриманими при ознайомленні з обставинами настання смерті. При наявності пошкодження дослідження, як правило, доцільно починати з тієї порожнини або частини тіла, де воно розташоване.
Основний розріз шкіри для розтину грудної та черевної порожнин виробляють від підборіддя до лобка (з обходом пупка зліва). Застосовуваний для цієї мети реберний ніж утримують горизонтально з тим, щоб розріз проводився його черевцем. Розріз проводять безперервним рухом, він повинен проникати через шкіру, підшкірну клітковину, досягаючи в області грудної клітини грудини, а в області живота - м'язів. Рани, рубці, сліди хірургічних операцій необхідно при цьому обходити. Переважно застосовувати Т-подібний, так званий воротнікообразний розріз, що йде під ключицями (від одного плечового суглоба до іншого), а від середини цього розрізу - донизу до лобка з подальшим отсепаровиваніем (без серединного розрізу) шкіри шиї.
Після проведення розтину шкіри розкривають черевну порожнину. Шкірно-м'язові клапті на грудях після розтину черевної порожнини отсепаровивают в обидві сторони так, щоб оголилися ребра. Прямі м'язи живота вище або нижче пупка перерізають в поперечному напрямку, що розширює доступ в черевну порожнину. Її оглядають послідовно зверху вниз. При наявності ушкоджень, пухлин, сторонніх накладень та ін. Відзначають їх локалізацію, розміри, форму, характер ранових каналів та ін. Звертають увагу на наявність, характер і запах випоту, оглядають органи малого тазу. На трупах жінок звертають увагу на стан матки і придатків. Перевіряють рівень стояння куполів діафрагми по відношенню до ребер. Якщо раніше на органах черевної порожнини проводилася операція, то ретельно досліджують операційне поле. Описують кількість, точне розташування і стан накладених швів.
Після огляду черевної порожнини перетинають грудинно-ключично зчленування і хрящові відділи ребер. За видаленні грудини відкривається широкий доступ в грудну порожнину. Органи оглядають на місці, після чого витягують з трупа і для подальшого вивчення поміщають на препаровальной столик.
Існує різний порядок дослідження органів. Можна вивчати їх по системам, розкриваючи спочатку серце і судини, потім органи дихання, травлення та ін. Застосовують також дослідження органокомплекса по «розташуванню» - спочатку розкривають органи, розташовані в його дорсальній частини, а потім розташовані спереду. Найбільш зручним є поділ органокомплекса при його дослідженні на органи порожнини рота і шиї, органи грудної порожнини та органи черевної порожнини.
При дослідженні органів порожнини рота і шиї дуже бажано, окрім мови, мигдалин, щитовидної залози, досліджувати внутрішні яремні вени, загальні сонні артерії, блукаючі і діафрагмальні нерви, а також симпатичні стовбури. При пошкодженнях шиї зазначені дослідження проводять в обов'язковому порядку.
Дослідження серця починають з вимірювання його до розтину. При цьому визначають найбільшу довжину, ширину, товщину і масу серця. Вінцеві артерії доцільно досліджувати як на поздовжніх, так і на поперечних зрізах, що. дозволяє отримати повне уявлення про характер ураження вінцевих артерій, наявності або відсутності на внутрішній поверхні артерій елементів атеросклеротичного ураження, звуження просвіту та ін. Після розкриття порожнини серця необхідно дослідити стан стулок і клапанів, виміряти периметр клапанних отворів, описати характер сосочкових м'язів і сухожильних ниток, а також м'язи серця в різних відділах.
При дослідженні органів травної системи необхідно у всіх випадках докладно описати вміст шлунка і кишечника.
Після розрізу та огляду м'яких покровів черепа, розпилу і відділення кісток черепа вивчають головний мозок, звертаючи увагу на тверду мозкову оболонку, кровонаповнення її судин і синусів, а також на стан м'яких мозкових оболонок. Досліджують артерії основи мозку, кору великих півкуль, внутрішню капсулу, бічні шлуночки, амонію ріг, гіпофіз і шишковидну залозу. За видаленні твердої мозкової оболонки оглядають основу черепа, при необхідності розкривають додаткові пазухи.