Тканинним хемоцепторам Чернігівський надавав особливого значення в аналізі внутрішнього середовища всіх органів і тканин. Міжнародний симпозіум, скликаний з ініціативи Чернігівського і присвячений тканинної хеморецепции, приніс йому безліч однодумців серед зарубіжних фізіологів, і тканинна рецепція стала важливою проблемою всесвітньої фізіології. Фундаментальна праця Чернігівського «Інтероцептори» переведений на андійський мову, виданий у США *.
Уже в п'ятдесятих роках Володимир Миколайович приступив до вивчення представництва внутрішніх органів в головному мозку і в його корі. Результат цих досліджень - книги «Нейрофизиологический аналіз кортико-вісцеральної рефлекторної дуги» і «кортикальної та субкортикальні представництво вісцеральних систем» («кортекс» - кора головного мозку, «вісцеральний» - внутренностний), удостоєні за рішенням Президії Академії наук СРСР премії імені Сеченова. Володимир Миколайович встановив, де в головному мозку знаходяться зони, відповідальні за діяльність певних внутрішніх органів.
Екстраполюючи виявлене ще в молодості явище «згасання» на интероцептивні процеси, Володимир Миколайович сформулював своє уявлення про реактивному гальмуванні - центральному мозковому процесі, який позбавляє організм від непотрібної, зайвої діяльності. Ці дослідження були виконані в п'ятдесятих роках та узагальнені в монографії «Звикання в вісцеральних системах».
В Інституті фізіології Чернігівський щотижня проводив семінар, на якому обговорювалися роботи співробітників. Часто обговорення переростало в дискусію, і в результаті її могли змінитися точки зору ряду її учасників, іноді й самого Капітана.
Проходить зовсім небагато часу, і В. Н. Чернігівський стає віце-президентом Академії медичних наук, дійсним членом Академії наук СРСР, постійним головою її відділення фізіології, членом академій ряду країн, депутатом Верховної Ради. Володимир Миколайович - ініціатор і головний редактор трідцатішестітомного керівництва з фізіології, один з основоположників радянської космічної фізіології.
Читач пам'ятає, що першими побували в космосі собаки. Перед стартом їх оперували: сонні артерії були виведені в шкірні муфти, щоб в процесі польоту можна було стежити за артеріальним тиском і частотою серцебиття. Тварин вибирав, спостерігав і оперував Володимир Миколайович. Чернігівський незмінно надавав допомогу космонавтиці в якості самого знаючого консультанта-фізіолога, входив до Міжнародну академію астронавтики, був членом редколегії радянсько-американського видання «Основи космічної біології і медицини». За сукупність робіт в 1964 році постановою Президії Академії наук СРСР він нагороджений золотою медаллю імені Павлова.
У ці роки школою Чернігівського стали багато фізіологічні лабораторії країни. «Вся творча діяльність його відзначена рисою, - пише Г. П. Конраді.- Мистецтво добування бездоганно достовірних фактів він поєднував із стриманістю і самокритичністю у висновках і узагальненнях. Яку б проблему ні розробляв В. Н. Чернігівський, він ніколи не забував про своїх попередників і виявляв величезну ерудицію в історії фізіології. І жодну проблему Володимир Миколайович не уявляв собі як цілком дозволену. Враховуючи найбільшу складність процесів в живих організмах, він найменше був схильний створювати «системи» і «загальні теорії», так легко перекидається поступальним рухом науки. Це мудре самообмеження вченого і скромної людини - запорука того, що його статті (а їх понад чотириста) та книги (одинадцять) не тільки не застарівають, але навпаки, адресовані майбутньому ».
Завжди вірив у своїх учнів, Володимир Миколайович і сам залишався вірним їм: дбав про їх роботу, її розумному плануванні, правильності виконання і точності висновків. Неможливо забути, як він вислухав від першої до останньої сторінки дисертацію одного з нас, уважно вникаючи в подробиці і вносячи свої корективи, хоча в той період ця робота виконувалася під іншим керівництвом. Дисертація була успішно захищена. Через кілька днів учитель і учень зустрілися на захисті інший дисертації в Академії медичних наук СРСР. Угледівши свого колишнього учня в залі, віце-президент встав, легко пройшов по центральному проходу в задні ряди, привітав і розцілував автора і, задоволений, повернувся за стіл вченої ради.
Разом з тим Чернігівський, безсумнівно, цінував у нас те, що ми нечасто зверталися до нього за допомогою. Він постійно домагався від учнів самостійності мислення. Першу наукову статтю він десять разів повертав одному з нас для виправлення, надаючи автору самостійно зрозуміти і усунути причину його невдоволення. Це мало глибокий виховний зміст - ми навчилися бути гранично вимогливими до себе, навчилися не посовати в найскладніших ситуаціях. І тут у нагоді рада Капітана: «Якщо вам щастить - продовжуйте. Якщо не щастить - продовжуйте », - повторював він.
Робота під керівництвом В. Н. Чернігівського, тісне спілкування з ним наклали відбиток на наші характери, долі і людські якості. Нам здається дуже важливим процитувати уривок з останнього листа чудового вченого і вчителя до одного з нас (йдеться про Військово-морської медичної академії):
«Це був гарний заклад взагалі, а для мене особливо. Там я «знайшов» ... (слід список членів команди). Для всіх нас, незважаючи на негаразди, ВММА була свого роду Ліцеєм! Там ви всі вчилися, а разом з вами вчився і я ... Всі ви свій гарний приписуєте мені. Якщо і було що «від мене», так тільки одне. Зумів я побачити в кожному з вас дорогоцінну для науки, наукового справи іскорку і не дав їй згаснути. От і все ...
Ваш В. Н., він же В. Чернігівський ».
У будь-якого життя, навіть якщо вона і не особливо коротке, залишається щось нереалізоване. Володимир Миколайович розумів це і надзвичайно цінував час. Він любив повторювати вірші Маршака:
Дорого вчасно час.
Часу багато і мало.
Довгий час - не час,
Якщо воно минуло.
Тим дорожче для всіх нас, його учнів, роки, які він витратив на команду створеного ним брига. Як постійне нагадування про це один з нас береже том «Інтероцептори» з дарчим написом Володимира Миколайовича: «З зарості піднявся корабель- він сплив і зупинився по самій середині зорі. З цієї дали він був видний ясно, як хмари. Розкидаючи веселощі, він палав, як вино, троянда, кров, уста, червоний оксамит і яскраво-червоний вогонь ... »
* В. Н. вельми пишався й тим, що його обрали після доповіді На одному з наукових симпозіумів в США членом суспільства гумористів імені Марка Твена.