Довгий час медиків цікавила причина зниження чисельності корисних і буйного росту патогенних бактерій в запаленій кишечнику. У здоровому організмі імунітет людини не реагує на корисні бактерії. Але варто тільки статися збою, як захисні реакції звертають свою силу на корисну флору. В результаті людина відчуває дискомфорт, біль у животі, розлади травлення.
Механізм отримання шкідливими бактеріями переваг, порівняно з корисними вивчили фахівці з Каліфорнійського університету в Девісі (США). Виявляється, в результаті запалень кишечника активно виділяється радикали оксиду азоту. Ці речовини призначені для боротьби з бактеріями. Але радикали швидко вступають у хімічну реакцію і перетворюються в стабільні нітрати. Саме нітратні сполуки використовуються такими кишковими бактеріями як Enterobacteriaceae і Escherichia coli для дихання і отримання енергії з поживних речовин. Деякі види кишкових паличок пристосувалися посилювати запальні процеси, для вироблення більшої кількості нітратів.
Корисні бактерії розмножуються в обстановці безкисневого бродіння. Такий шлях розвитку дуже повільний. Якщо врахувати, що в цей час колонії корисної флори піддаються атакам імунітету, стає зрозумілим, чому кишкові палички їх переростають, хоча теж перебувають під ударом.
Перед вченими стоїть завдання навчити імунітет розрізняти корисні і шкідливі бактерії і придушити зростання останніх.