До теперішнього часу не привернув до себе належної уваги надзвичайно важливе питання про правильну госпіталізації хворих стафілококової інфекції. У більшості випадків їх поміщають в загальні палати з хворими, що страждають захворюваннями іншої етіології, що веде до перехресної інфекції і обумовлює внутрішньогоспітальних зараження. Останнім часом хворих з довгостроково поточними, непідвладними звичайної антибіотикотерапії пневмоніями нерідко направляють в туберкульозні відділення з діагнозом туберкульозу легенів. Внаслідок цього спостерігалися випадки зараженні хворих на туберкульоз стафілококової інфекції і навпаки.
Особливу небезпеку становлять хворі стафілококових захворюваннями при госпіталізації їх в хірургічні відділення. Зрозуміло, неприпустимо залишати в загальних палатах новонароджених з найменшими ознаками стафілококових інфекцій (мокнутіє пупка, піодермія). Відомі масові спалахи стафілококових інфекцій в пологових будинках з дуже важким перебігом і високою летальністю. Своєчасна ізоляція і правильне розміщення хворих зі стафілококової інфекції - ефективний захід попередження як масових спалахів, так і окремих захворювань.
В даний час вкрай необхідно створення в інфекційних лікарнях стафілококових відділень, а у відділеннях хірургічного профілю в пологових будинках - окремих палат для хворих зі стафілококових ускладненнями. Своєчасна ізоляція хворих позначається і на перебіг захворювань. Ізоляція хворих в боксах сприяла зменшенню вдвічі стафилококкового сепсису. Особливо важлива ізоляція хворих з післяопераційними ранами, термічними опіками, а також новонароджених.