Лікування вегето-судинної дистонії повинне бути комплексним, тривалим і індивідуальним. Перевагу віддають немедикаментозним методам. До них відносять нормалізацію режиму дня, усунення гіподинамії, дозоване фізичне навантаження, обмеження емоційних впливів (телепередачі, комп'ютерні ігри), індивідуальну та сімейну психотерапію, а також регулярне і раціональне харчування. Позитивний ефект роблять лікувальний масаж, голкорефлексотерапія, водні процедури.
При недостатній ефективності проведеного лікування призначають індивідуально підібрану медикаментозну терапію.