Лікування будь-якого коліту починається з призначення спеціальної дієти. Подальша тактика залежить від конкретної причини захворювання. Якщо до захворювання призвела кишкова інфекція, можуть бути призначені антибіотики. Якщо коліт викликаний тривалим застосуванням ліків, препарати відміняють. При хронічних колітах застосовуються спазмолітики (наприклад, но-шпа), регулятори кишкової моторики, антидіарейні засоби (наприклад, лоперамід, имодиум), протизапальні засоби (наприклад, сульфасалазин), у важких випадках - глюкокортикоїдних гормони.