Захист від зброї масового ураження в цивільній обороні здійснюється під керівництвом начальників ГО районів (областей, країв, республік). Для проведення заходів щодо захисту населення залучаються різні служби: медична, захисту тварин і рослин, охорони громадського порядку, комунальна, протирадіаційного і хімічного захисту, продовольчого та речового постачання, матеріально-технічного забезпечення, зв'язку, транспортна та ін.
Заходи щодо захисту від зброї масового ураження в ГО проводяться: а) у мирний час-б) при загрозі нападенія- в) після застосування противником зброї масового ураження.
У мирний час здійснюються розробка планів по захисту від зброї масового ураження населення, промислових і сільськогосподарських об'єктів-навчання населення способам захисту і підготовка формувань ГО створення запасів коштів захисту-будівництво захисних сооруженій- підготовка системи оповіщення та зв'язку.
Основними заходами щодо захисту від зброї масового ураження в ГО, проведеними в мирний час медичним персоналом, у тому числі і середнім, є навчання населення прийомам надання само- та взаємодопомоги, а санітарних дружин - надання першої медичної допомоги (див. Медична допомога, у військово-польових умовах), навчання користуванню індивідуальними засобами захисту (протигаз, респіратор, захисний одяг та ін.), методам проведення екстреної і специфічне профілактики та знезараження вогнищ зараження.
При загрозі нападу наводиться в готовність система оповіщення і зв'язку, штаби, служби ГО і санітарно-профілактичні установи-здійснюється евакуація в заміську зону населення і розосередження робітників і службовців об'єктів народного господарства, які не припиняють роботу у воєнний час-висновок і розгортання в заміській зоні сил і засобів ГО розосередження і укриття в заміській зоні матеріальних засобів-заходи щодо захисту продовольства, води і продуктів сільського господарства від радіоактивного, хімічного і бактеріального зараження- видача населенню та особовому складу формувань індивідуальних засобів захисту та ін. У цей період медперсонал, в тому числі і середній, бере участь у проведенні санітарно-гігієнічних і протиепідемічних заходів, надає медичну допомогу нужденним, здійснює спостереження і лабораторний контроль за зараженностью об'єктів зовнішнього середовища, приводить у готовність сили і засоби медичної служби.
Після застосування противником зброї масового ураження проводиться медична розвідка (Див.) Та санітарно-епідеміологічна розвідка, санітарна обробка заражених (див. Санітарна обробка), Знезараження вогнища (див. Дегазацію, дезактивацію, Дезінфекція), лікувально-евакуаційне забезпечення уражених - див. Вогнище масових уражень, Хімічна зброя, Ядерна зброя. У всіх цих заходах бере участь середній медперсонал.