Працями І. П. Павлова і його послідовників встановлено, що процеси перетравлення їжі в організмі людини регулюються ЦНС. Порушення в діяльності вищих відділів ЦНС негативно впливають на моторику і секреторну функцію шлунково-кишкового тракту. Захворювання органів травлення, в свою чергу, можуть відбиватися на функціональному стані ЦНС і бути причиною порушень обміну речовин.
При захворюваннях травної системи можуть наступати порушення, які проявляються в ослабленні або перекрученні секреторної функції травних залізні в розладі моторної функції, що забезпечує просування їжі по травному каналу- в погіршенні всмоктування їжі-в диспептических розладах. Подібні порушення називають функціональними захворюваннями. До цієї групи захворювань відносять також опущення органів черевної порожнини, спазм воротаря, дискінезію жовчовивідних шляхів.
Крім функціональних виділяють органічні захворювання. До них відносять запалення слизових оболонок травної системи (гастрит, виразкову хворобу, коліт), печінки і жовчовивідних шляхів (цироз, гепатит, холецистит) і злоякісні пухлини.
Етіологічні фактори більшості захворювань шлунково-кишкового тракту досить різноманітні. Причинами захворювань можуть бути: порушення нервової регуляції травлення (нейрогенний фактор), вживання гострої або недоброякісної їжі (харчовий фактор), вплив алкоголю, кислот, лугів та інших хімічних речовин (хімічний фактор), вплив патогенних мікроорганізмів (інфекційний чинник).
До захворювань обміну речовин відносять такі хвороби, які розвиваються в результаті розлади функції залоз внутрішньої секреції, порушення вуглеводного, жирового або білкового обміну, неправильного харчування, інтоксикації та інших причин. Серед цих захворювань найбільш часто зустрічаються ожиріння, цукровий діабет, подагра.