Для більш ефективного використання з лікувальною метою фізичних вправ методики заняття будуються з урахуванням фази розвитку хвороби. Розрізняють три періоди лікувального застосування фізичних вправ.
Перший період відповідає фазі мобілізації організмом фізіологічних механізмів боротьби з хворобою і фазі формування тимчасових компенсаторних механізмів. Основні завдання лікувального застосування фізичних вправ у цей період - стимуляція фізіологічних механізмів боротьби з хворобою, сприяння формуванню найбільш повноцінних тимчасових компенсаторних механізмів, профілактика ускладнень.
Другий період має місце у фазі зворотного розвитку змін, викликаних хворобою, і формування постійних компенсацій при незворотності цих змін. Основними завданнями лікувального використання фізичних вправ відповідно стають сприяння якнайшвидшої ліквідації морфологічних змін і патологічних порушень різних функцій і в деяких випадках - формуванню постійних компенсацій.
Третій період відповідає завершенню періоду реконвалесценції. Основні завдання лікувального застосування фізичних вправ у цей період - сприяння ліквідації залишкових морфологічних і функціональних порушень, викликаних хворобою, і відновлення адаптації до звичних виробничо-побутовим м'язовим навантажень і умов. При наявності необоротних порушень забезпечується закріплення сформованих постійних компенсацій.
Оформлення призначень на лікувальну фізичну культуру проводить лікуючий лікар. Лікар лікувальної фізичної культури вказує в історії хвороби: а) основну задачу лікувальної фізичної культури, б) рекомендовану форму занять лікувальною фізичною культурою, в) період лікувальної фізичної культури, г) руховий режим. При поліпшення або погіршення стану хворого лікар, записуючи ці зміни в історії хвороби, при необхідності вносить одночасно поправки в рекомендації щодо лікувальної фізичної культури. Призначаючи або скасовуючи її, він повинен дати письмове обгрунтування цього в історії хвороби.
Лікар або інструктор з лікувальної фізичної культури заповнює на кожного хворого картку лікувальної фізичної культури, в якій враховуються проведені заняття, реакції хворого на фізичне навантаження і всі дані про методику занять.