Зустрічаються дві аномалії розвитку піхви: аплазія піхви і подвоєння піхви.
Аплазія піхви. Повна відсутність піхви (aplasia vaginae) є наслідком повної відсутності розвитку мюллерових ходів. Як відомо, нижня третина піхви розвивається з сечостатевої пазухи, тому у разі відсутності піхви між великими статевими губами мається ладьеобразное поглиблення (глибина його зазвичай не перевищує 3 см).
Вроджена відсутність піхви часто виявляється лише в підліткових віці, коли дівчинка вперше звертається до лікаря зі скаргою на те, що ще не почалася менструація, або ще пізніше, коли дівчина збирається заміж. Рання діагностика має велике значення ще й тому, що можуть існувати й інші аномалії розвитку внутрішніх статевих органів, органів сечової системи і кісток таза.
При природженому відсутності піхви зовнішні статеві органи зазвичай здаються нормальними, хоча може мати місце повна відсутність передодня піхви або його замінює невелике заглиблення. У рідкісних випадках зустрічається поперечна перегородка між верхньою і середньою третиною піхви, що симулює вроджена відсутність його. Поздовжня перегородка піхви є значно меншим дефектом, ніж повна відсутність його. Хоча рання діагностика має велике значення і при згаданих анатомічних відхиленнях, вони все ж не вимагають термінового хірургічного втручання. Оскільки ці аномалії статевої системи у дитини не супроводжуються функціональними розладами, можна почекати до настання статевої зрілості, коли у зв'язку з початком функцією яєчників виникає показання до хірургічного втручання. Це особливо відноситься до тих випадків, коли розвиток матки, труб і яєчників протікає нормально.
Vagina septa, subsepta. Якщо не відбувається злиття дистальних кінців мюллерових ходів, то з їх стінок, розташованих одна над іншою, утворюється перегородка. Її товщина може бути дуже різною. Ця аномалія зустрічається і ізольовано, але найчастіше поєднується з подвоєнням матки. Як правило, одна половина піхви більш широка. Ця аномалія в дитячому віці не викликає скарг.
Перегородка являє собою мембрану різної толщіни- вона вистелена нормальної слизовою оболонкою. Якщо є запальні зміни, то вони є вторинним наслідком застою і інфекції. Сагітальній перегородка, яка найчастіше розташовується медіально, може поширюватися на всю довжину піхви або тільки на короткий відрізок його-тоді говорять про vagina septa, або subsepta. Зустрічається і поперечна перегородка у вигляді півмісяцевою або кільцеподібної складки, в центрі якої є отвір різного діаметру. Рідше зустрічається мостовидной перегородка.