На сьогоднішній день існує два основні методи лікування ендометріозу:
За допомогою гормональних препаратів лікар-гінеколог моделює у жінки повна відсутність місячних і вогнища ендометріозу атрофуються самі по собі. Курс лікування, як правило, тривалий - протягом півроку. Однак ці препарати можуть викликати серйозні побічні ефекти і висока ймовірність відновлення процесу після припинення їх прийому.
Більш ефективний метод - хірургічний. Ще 15 років тому до ендометріозу підходили радикально, видаляючи уражені органи і матку. Сьогодні методом лапароскопії вдається видалити тільки вогнища ендометріозу (лазером або електрокоагуляції), зберігши при цьому внутрішні статеві органи.