Лікування бородавок повинно проводитися тільки під контролем лікаря-дерматолога, оскільки неправильне лікування може призвести до збільшення їх числа. Єдиним методом боротьби з бородавками є їх видалення. На сьогоднішній день існує досить багато методів їх знищення. Всі процедури безболісні, а метод вибирається лікарем залежно від місця розташування і виду бородавки.
При електрокоагуляції використовується струм високої частоти, який викликає підвищення температури в тканинах і, як наслідок, - руйнування бородавок.
Лазеротерапія, або видалення бородавок за допомогою лазера досить ефективно, але може викликати утворення рубців.
Кріотерапія досить проста і безболісна. При цьому відсутній контакт з кров'ю, так що немає загрози інфікування. Однією з її сучасних різновидів є кріотерапія рідким азотом.